慢性乙型肝炎患者，将有更大的风险发展成肝癌。确切的原因还不清楚，但一些调查表明，慢性乙型肝炎患者的肝癌发生率，为正常人的200倍以上。通常情况下，肝硬化的患者，发生肝癌的概率更高，但也有的患者，未经过肝硬化阶段，而直接发展成为肝癌。实际上，在世界范围内，乙型肝炎流行的区域里，有30％的慢性乙型肝炎患者，在末进入肝硬化阶段时，已发展成肝癌。肝癌每年可引起全球约745,000人死亡。
2014年6月份在国际胃肠病学权威期刊《Gastroenterology》杂志发表的两项最新研究提供了强有力的证据表明，抗病毒疗法可以降低慢性乙肝患者的肝癌风险。Gastroenterology是美国胃肠病协会的官方刊物。
在第一篇文章中，来自台湾国立阳明大学的研究人员发现，在一个大的、全国性的慢性乙肝患者队列中，通用的口服抗病毒药物核苷（酸）类似物（NUC）可减少长期的肝癌风险。这项回顾性研究，在用几种不同药物治疗的患者之中，分析了肝细胞癌（肝癌最常见的形式）的风险。与对照组相比，用NUC治疗的组群，具有显著更低的七年肝癌发病率。总体而言，对于降低肝癌风险的治疗效果，在没有肝硬化的年轻患者和非糖尿病患者中更为明显。
本研究第一作者吴俊颖（音译，Chun-Ying Wu）博士称：“我们的研究结果表明，使用NUC降低了慢性乙肝患者的肝癌风险，特别是具有最小肝损伤的较年轻患者。大型队列增加了我们研究的可信度，带来了关于‘谁会从治疗中受益最多’的可靠结果。”
第二项研究也是一项回顾性研究，是在韩国首尔的一家三级护理医院开展的，研究人员将抗病毒药物恩替卡韦（entecavir）和一种不太有效的药物拉米夫定（lamivudine）治疗的慢性乙肝患者进行比较。他们发现，恩替卡韦治疗的患者组比拉米夫定治疗组，具有显著更低的死亡和移植风险。然而，这种风险的降低并不能转化为肝癌的风险降低。这两组都表现出相似的肝癌减少。
本文共同作者、韩国蔚山大学医学院肠胃病学系的Young-Suk Lim指出：“即使用最有效的药物治疗的乙型肝炎患者，都有一种持久的肝癌风险。基于我们的发现，我们建议，不论采用了什么疗法，应当继续监控慢性乙肝患者的肝癌风险。”
这两篇论文支持越来越多的证据表明，为了避免肝癌风险，需要在慢性乙肝感染早期就开始使用抗病毒疗法，最好在晚期肝纤维化阶段之前。