由《中华传染病杂志》发起了此次“1999-2009慢性乙肝防治临床十大进展”评选活动 ，经过《中华传染病杂志》抽印本、《中国医学论坛报》版位宣传、“好医生”网站投票和专家评审会等投票评选及审核，于2009年10月10日公布。
1. 1999年第一个口服核苷类似物拉米夫定在中国上市。
2. 1999年实时聚合酶链反应 (PCR) 技术开始广泛用于乙肝病毒核酸 (HBV DNA) 水平的定量检测。
3. 1999年拉米夫定被用于接受免疫抑制剂治疗患者乙肝复发的预防性治疗。此后，2001年拉米夫定又用于肝移植后乙肝复发的预防性治疗。
4. 2000年发布《病毒性肝炎防治方案》。
5. 2000年公开发表《拉米夫定临床应用指导意见》，此后多次更新并发表《拉米夫定临床应用专家共识》。
6. 2002年乙肝疫苗纳入计划免疫。
7. 2002年台湾学者关于HBeAg水平以及HBV DNA水平与肝癌发生率相关性的研究结果公布，与2004年证实拉米夫定可以延缓乙肝肝硬化患者的疾病进展和肿瘤发生的4006研究共同奠定了抗病毒治疗延缓疾病进展的重要基石。
8. 2005年《中国慢性乙型肝炎防治指南》面世。
9. 2005年阿德福韦酯在中国上市。同年聚乙二醇化干扰素α2a和恩替卡韦在我国被批准用于治疗慢性乙肝。2007年替比夫定和聚乙二醇化干扰素α2b在我国被被批准用于慢性乙肝治疗。
10. 2008-2009年出台慢性乙肝抗病毒治疗的优化方案。