肝癌的治疗方法大致为二种，一种是手术切除肿瘤，或相当于手术切除的其他方法，比如激光、冷冻、放疗、肝动脉栓塞治疗、肝动脉的插管化疗、全身化疗等。一种是支持疗法的免疫治疗和高营养治疗。临床上要根据病人的病情，选择适宜的治疗方法。
(1)如病人属早期或中期，肝功能代偿较好，可进行手术探查，根据病情进行根治性切除或姑息性切除。
(2)无切除可能进行肝动脉栓塞。
(3)根治术后，如有复发或转移，可行再切除术。
(4)姑息性切除后，应进行综合治疗。肝动脉栓塞术后也可进行综合治疗。综合治疗指全身化疗、放疗、插管化疗、免疫治疗等。
(5)肝功能失代偿期或晚期，可选用中药治疗和支持疗法，并加用肝动脉栓塞或瘤内酒精注射的治疗方法。总的来说，肝癌治疗原则是早期治疗，和进行综合治疗。因为早期治疗是最有效的治疗方法，比如手术切除或其他相当于手术切除的方法，而且肝癌肿物越小，效果越好。
基于目前肝癌尚无特效疗法，临床上肝癌病人一经诊断能够施行手术切除的仅占少数，大量病人有赖于各种非手术的治疗方法。于是肝动脉结扎、肝动脉栓塞、放射治疗、免疫治疗等合理的综合手段进行治疗，使一些单独治疗效果不佳的病例提高了疗效。但制订一套适合病人个体情况的综合治疗方案，是治疗效果的保证。
另外，手术根治切除后，临床类似复发与转移的施行“再”切除。以及肝癌病人先施行肝动脉结扎、栓塞、冷冻、癌内注射抗癌剂等姑息性外科治疗后，发现肿瘤明显缩小，再行二期切除，可使根治无望的病例成为有根治希望。