治疗慢性肝炎和肝硬化，目前尚无特效药物。除了一些一般治疗外，近年来，如何迅速杀灭乙肝病毒，终止病毒对肝细胞的损害，成为研究的重点。3至6个月干扰素-α治疗可使30%-40%的病人在开始治疗的12个月内HBV复制受抑制(HBeAg消失，分子杂交法HBV DNA转阴），且肝脏病变得到改善。但干扰素治疗费用昂贵，仅部分有效，尤其对ALT正常的亚洲病人效果较差。
1999年在中国正式上市的拉米夫定是一种新型核苷类药物,，全称2’,3’一二脱氧3硫代胞嘧啶（3TC）。其进入细胞后，磷酸化为三磷酸拉米夫定而发挥作用。拉米夫定作用的靶位是HBV聚合酶反转录活性区YMDD（酪氨酸、蛋氨酸、门冬氨酸、门冬氨酸）基序。在HBV复制周期中，HBV侵入细胞内，其核心部分进入胞核，部分双链的环状DNA分子转变成超螺旋共价闭合环状DNA(cccDNA)，然后合成前基因组RNA，再以此为模板在HBV聚合酶作用下反转录负链DNA，最后复制成部分双链的环状DNA。HBV聚合酶的抑制将抑制前基因组RNA反转录为负链DNA，阻断新合成HBV DNA的链化，从而抑制HBV的复制。该药具有疗效佳，毒性低的特点，HBV DNA受抑制，ALT复常，肝组织学改善，肝纤维化进展减缓，HBeAg转换率提高。
中医中药在肝病的治疗中一直占有相当重要的地位，如茵知黄注射液，垂盆草冲剂等长期以来得到了临床的广泛应用并取得了良好的疗效。但是正是由于乙肝的难治性，市场上出现了许多不明制剂，言必称转阴率80％以上，听起来言之凿凿，实际一分析便是漏洞百出。更有神秘军医，祖传秘方，打着为民解忧的旗号，回收那动则几百上千的病人血汗钱。
事实上，乙肝并不可怕，国家颁布的《乙肝表面抗原携带者管理指南（草案）》中规定应正确或恰当对待HBsAg携带者的入托、入学、就业、婚育等实际问题，不应受到歧视。而乙肝病人本身也应正视疾病，积极配合正规治疗，千万不要听信江湖郎中夸大其词的谎言，以免贻误病情，浪费钱财，造成终身的遗憾。