一个完整的乙肝病毒颗粒（见下图），也被称为Dano颗粒，直径只有42纳米，大约是一个普通鸡蛋的百万分之一。乙肝病毒有外壳和核心两部分，也就是说，除了大多数病毒漂亮的“衣壳”，乙肝病毒还必须加上一层复杂且结构精密的“外衣”。外壳是所谓的“外壳”，厚度为7-8纳米，由一个脂质双层和一个蛋白质胶囊组成。脂质双层含有S抗原、前S1抗原和前S2抗原。它们共同构成三种蛋白质形式：大、中、小形式。它们统称为乙型肝炎表面抗原（HBsAg），通常被称为抗澳大利亚。还有一个关于澳大利亚抗体起源的故事，它最初是从澳大利亚土著人的血清中分离出来的。当时，它被认为是当地人独特的遗传标记，因此被称为“澳大利亚抗原”。后来才知道是乙型肝炎病毒表面抗原。所谓的抗原实际上是能引起机体抵抗反应的元素。相反，能够识别和抵抗体内抗原的元素是抗体。
（显微镜下的乙肝病毒）
通过剥去Dano颗粒的外壳，暴露了乙型肝炎病毒的核心颗粒。核心粒子直径为28纳米，在二十面立体中是对称的。核心颗粒的表面是病毒的真正外壳，由乙型肝炎病毒核心抗原（HBCAG）构成。游离态核衣壳只能在肝细胞的细胞核中观察到。乙肝病毒的另一个主要抗原E也可以通过强力洗涤剂或酶处理方式暴露出来。它的本质不是很清楚，但大多数人认为它是核心的碎片。
Dano颗粒的中心部分是圆形和缺口DNA双链，并与DNA聚合酶连接。乙型肝炎病毒基因组最显著的特征之一是它非常小，它的DNA分子含有大约3200个核苷酸，比已知的最大病毒基因组小数百倍。与人类基因组相比，它只是百万分之一。此外，两股HBV DNA的长度不同，两股的长度是完整的，长度是恒定的，两股是负的。短链是长度可变的正链，约占长链的50%至80%。表面抗原和核心抗原都是由丹麦粒子的DNA编码的。
（乙肝的横切面图）