乙型肝炎病毒是一种双层结构，外有外壳，内有核心的亲肝病毒族。在电镜下呈三种形态，即小球形颗粒、管状颗粒和大球形颗粒。
大球形颗粒是完整乙型肝炎病毒颗粒，也称丹氏（Dane）颗粒。大球形颗粒又可分为外壳和核心两部分。大球形颗粒的外壳、小球形颗粒和管状颗粒都含有乙型肝炎表面抗原（HBsAg）；大球形颗粒的核心中含有乙型肝炎核心抗原（HBcAg）和乙型肝炎e抗原（HBeAg）以及3200对核苷酸组成的缺口双股环状DNA和DNA多聚酶。
乙型肝炎表面抗原（HBsAg）、乙型肝炎核心抗原（HBcAg）和乙型肝炎e抗原（HBeAg）分别激发人体产生相对应的乙型肝炎表面抗体（抗HBs）、乙型肝炎核心抗体（抗HBc）、乙型肝炎e抗体（抗HBe）。HBsAg和抗HBs；HBcAg和抗HBc；HBeAg和抗HBe，就是乙型肝炎三大抗原抗体系统。乙型肝炎三大抗原抗体系统的发现，极大地推动了乙型肝炎诊断、治疗和预防。